近日，Theoretical and Applied Genetics 在线发表了广东省农业科学院植物保护研究所水稻病害防控课题组，题为“Identification and fine-mapping of Xo2, a novel rice bacterial leaf streak resistance gene”的研究论文[1]，该研究为水稻细菌性条斑病的标记辅助选择抗性育种和Xo2 基因的进一步克隆奠定了基础。陈深研究员为论文第一作者、朱小源研究员为通讯作者。

水稻细菌性条斑病是由稻黄单胞菌稻生致病变种（Xanthomonas oryzae pv. oryzicola，Xoc）引起的最严重的水稻细菌性病害之一，发病范围广，危害严重，因此利用宿主抗病基因是控制该病的有效途径。

利用来源于孟加拉的抗细条病水稻品种X455与两个感病水稻品种金刚30和五山丝苗分别构建了F2分离群体，遗传分析显示，抗性水稻品种X455对细条病的抗性由一个主效位点控制。

利用水稻绿色基因芯片（GSR40K）对JG30/X455 F2作图群体的两个亲本及抗病、感病混池进行BSA分析，将Xo2 初定位在2号染色体10 Mb-12.5 Mb的区域内（图1），随后利用该区域的7个SSR标记将候选区间缩小到1cM（RM12943和RM12979之间）。为进一步精细定位候选基因，在候选区间中选择了9个SSR和3个InDel标记对五山丝苗/X455 F2作图群体进行基因分型，最终将候选基因精细定位于标记RM12941和D6-1之间的110kb区域内。

图1 利用水稻基因芯片GSR40K进行Xo2 的初定位

双绿源自主研发的水稻绿色基因芯片（GSR40K）在该研究中快速对基因进行了BSA初定位，加速了后续候选基因的确定。

【参考文献】

[1] Chen S ,  Feng A ,  Wang C , et al. Identification and fine-mapping of Xo2, a novel rice bacterial leaf streak resistance gene[J]. Theoretical and Applied Genetics, 2022, 135(9):3195-3209.

原文链接：https://doi.org/10.1007/s00122-022-04179-9